CMA – 염색체 마이크로어레이

염색체 마이크로어레이 분석은 전체 게놈의 결실과 중복 검출을 위한 최적 표준입니다.

개요

보고

방법

검체 요구사항

한계 영역

CMA 개요

CMA
검사 적용
증상 및 질환

어레이 CGH로도 알려진 염색체 마이크로어레이 분석(CMA)은 게놈 전체의 임상적으로 중요한 주요 염색체 불균형(비정배수성)과 미시적(미세 결실/미세 중복) 복제 수 변이를 검출할 수있는 진단 검사입니다.
염색체 마이크로어레이 분석은 전체 게놈의 결실과 중복 검출을 위한 최적 표준입니다.
CMA는 핵형이 검출할 수 없는 작은 영역을 시각화할 수있는 미시적인 해상도를 제공합니다. CMA의 감도는 사용되는 분자 프로브의 수와 게놈 범위에 따라 달라집니다. 프로브의 수가 많을수록(180K, 400K, 750K…) 감도가 높아집니다.

CMA는 다음을 검출할 수 있습니다.

작은 염색체 미세 결실 및 중복
복제수 변이
염색체의 수적 이수성
불균형 재배열
과도한 동종접합성 – 플랫폼에 따라 다름
유전성 열성 질환 또는 각인 장애의 암시적인 위험 – 플랫폼에 따라 다름
삼배체 및 사배체 – 플랫폼에 따라 다름
20-30 % 이상의 섞임증

임신 전

CMA는 다음 징후 중 한 개 이상에 해당되는 경우 임신 전 단계에서 사용할 수 있습니다.

이전에 감염된 어린이가 정상적인 핵형 또는 WES를 나타내지만 유전적 상태가 의심되는 경우
영향을 받은 아동에서 검출된 복제수 변이가 새로운 것인지 또는 부모로부터 유전되었는지 확인하기 위해

균형 잡힌 염색체 재배열이 의심되는 경우(즉, 습관성 유산, 불임 등) 항상 양 부모의 체질 핵형 검사를 권장합니다.

산전(產前)

CMA는 다음 징후 중 한 개 이상에 해당되는 경우 산전(產前)에 사용합니다.

비정상적인 태아 초음파
비정상적인 NIPT 결과가 태아의 염색체 이상 위험 증가를 나타낸다.
비정상적인 고위험 산모 혈청 검사
부모는 알려진 염색체 재배열, 섞임증 또는 이전 이수성을 가지고 있다.
부모가 이전에 염색체 이상이 있는 정상 출산 또는 사산을 한 적이 있다.
불균형 염색체 이상의 심각한 위험을 나타내는 초음파 또는 MRI로 검출한 선천성 태아 이상
선천성 이상이 있는 태아에서 명백하게 균형 잡힌 유전적 재배열
G-band 분석(핵형)으로 식별된 균형 잡힌 드보노 재배열
고위험 임신

출생 후

CMA는 아래 징후 중 한 개 이상에 해당되는 아동기 또는 성인기에 사용합니다. 염색체 마이크로어레이는 다음에서 1차 검사로 간주될 수 있습니다.

개인 또는 태아가 잘 식별되는 유전적 증후군에 국한되지 않는 여러 선천성 기형을 보이는 경우
핵형이 음성이고 개체의 표현형이 염색체 이수성을 나타내는 경우
개인 또는 태아가 뚜렷한 비증후군성 발달 지연 또는 지적 장애를 보이는 경우
개인이 자폐 스펙트럼 장애를 보이는 경우
태아가 기형이거나 원인을 알 수 없는 사산이 발생한 경우

CMA는 아래 증상 또는 상태 중 한 개 이상에 해당되는 경우 다른 검사로 구체적으로 진단을 내리지 못한 경우에 사용할 수 있습니다.

설명할 수없는 발작 장애
성장 지연
정신 질환
신경근 질환
신경근 질환
골격 이형성증
단신
과도한 성장
소두증
대두증

임신 제품

CMA는 자연 낙태 사례가 있는 경우 임신 제품에 사용할 수 있습니다.

CMA 보고 및 결과

Igenomix에서 다양한 유형의 CMA를 사용할 수 있습니다.

CMA HD(가장 민감한 검사)

복제수 프로브(190만) + SNP (750K)
전체 게놈 범위
낮은이종접합, 단친 이염색체성(UPD), 낮은 수준의 뒤섞임 및 검체 이질성의 영역을 검출할 수 있습니다.
가장 높은 프로브 밀도

CMA 750K(가장 비용 효율적인 검사)

복제수 프로브(550K) + SNP (200K)
임상적으로 관련된 영역 강조
UPD를 나타내는 과도한 동종접합성 영역의 식별, 혈족을 제안하고 추가 검사를 위한 후보 유전자 결정

CMA 검체 요구사항

다음의 검체 유형은 Igenomix 유전자 검사에 허용됩니다. 고유한 식별 정보로 튜브를 꼼꼼하게 라벨링하는 것이 필수적이며, 라벨링이 잘못되어 있으면 검체가 거부될 수 있습니다. 검체 식별 및 수락을 위해 필요한 최소한의 정보는 환자의 전체 이름, 생년월일, 성별 및 의료기록 번호입니다.

산모 혈액 검체는 모든 임신 부산물, CVS 및 Amnio 검체와 함께 발송해야 합니다.
모든 산전(產前) 검체에 우선 순위가 부여됩니다.

환자는 ‘검사대상자 동의서’ 양식과 ‘검사의뢰서 양식’(제공된 키트에 포함되어 있음)을 적절히 작성하여 서명 후 배송 상자 안의 검체와 함께 배송하거나 이메일로 실험실에 보내야합니다. Igenomix는 적절한 키트의 픽업 및 운송에 필요한 모든 문서를 실험실로 보내드립니다.

CMA 방법

50kb보다 작은 결실와 400kb보다 작은 중복은 검토되지 않을 수 있습니다. 검출된 복제수 변이(CNV)는 임상적 관련성이 명확하거나 의심되는 경우에 보고됩니다. 관련 유전자 함량이 없거나 일반 모집단에서 흔한 발견으로 보고된 CNV는 보고되지 않을 수 있습니다. 단일 LCSH가 8-15 Mb (염색체 위치와 각인 장애 확률에 따라 다름) 또는 총 상염색체 LCSH 비율이 3% 이상인 경우(3Mb보다 큰 상염색체 LCSH만 이 추정에 고려됨) 동종접합성 영역이 보고됩니다. 유전체 선형 위치는 NCBI build 37(hg19)을 기준으로 주어집니다.

검사 결과는 아래에 설명된 것처럼 ISCA (International Standard of Cytogenomics Arrays)의 권장사항 및 지침에 따라 해석됩니다.

양성(병원성과 유사 병원성)

양성 결과는 연구중인 질병 표현형과 관련하여 복제수 변이가 확인되었음을 나타냅니다. 이 시나리오를 통해 가능한 의학적 치료, 질병 진행, 생식/예방 전략 및 다른 가족 구성원에 대한 잠재적 영향에 관한 유전 상담 또는 개인 지침을 제공할 수 있습니다.

음성:

음성 결과는 수행된 검사에서 질병을 유발하는 복제수 변이가 확인되지 않았음을 나타냅니다. 이는 개인이 건강하거나 다른 유전적 장애 또는 의학적 상태가 없음을 보장하지 않습니다. 또한 음성 결과는 질병의 유전적 원인을 배제하지 않으며 미래의 자손에 대한 위험을 제거하지도 않습니다. 그러나 음성 검사 결과가 나오고 문제의 변이가 영향을 받는 가족 구성원에게 존재하는 것으로 알려진 경우 발단자의 유전적 장애 진단을 배제합니다. 음성 결과는 제한된 유전 지식과 사용된 방법과 관련된 제한사항을 비롯하여 여러가지 원인으로 설명될 수 있습니다.

비결정적/불확실한 변이형(VUS) :

불확실한 변이의 발견은 복제수 변이가 검출되었음을 나타내지만 현재 CNV가 유전 질환 또는 질병과 관련이 있는지는 알려지지 않았습니다. 불확실한 변이는 양성 결과와 동일하지 않으며 발단자가 유전적 장애나 질병을 일으킬 위험이 증가하는지는 명확하지 않습니다.
변화는 정상적인 유전적 변이일 수도 있고 질병을 유발할 수도 있습니다. 다른 가족 구성원과 영향을 받지 않는 다른 가족 구성원뿐만 아니라 두 부모 모두 검사를 받는 것을 비롯하여 추가 분석이 권장될 수 있습니다. 종종 발단자가 제시하는 표현형을 입증하기 위해 보조 검사를 수행해야 합니다. 결과를 명확히하기 위해 다른 가족 구성원의 상세한 의료 기록이나 정보가 필요할 수도 있습니다.
결과의 해석은 의학 문헌, 연구 및 과학적 데이터베이스에서 현재 사용 가능한 정보에 기초합니다. 문헌, 의학 및 과학 지식은 계속해서 변하기 때문에 향후 이용 가능한 새로운 정보가 Igenomix가 결과를 해석하는 데 사용한 정보를 대체하거나 추가할 수 있습니다. 새로운 증거를 고려하여 이전에 발행된 보고서의 결과에 대한 재분석은 정기적으로 수행되지 않지만 요청 시 수행됩니다.

CMA의 제한사항

CMA는 다음을 식별할 수 없습니다.
- 균형 잡힌 염색체 재배열(균형 전좌, 반전)
- 단일 유전자 서열의 작은 변화(점 돌연변이)
- 단일 유전자 내에서 DNA 세그먼트의 작은 중복 및 결실(예: 취약 X 증후군)
- 단친 이염색체성(UPD)
- 메틸화 변경
- 20 % 미만의 뒤섞임
- 완전한 배수성